Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UPK3BQ9BT76 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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