Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRACR2AQ9BSW2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms