Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms