Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA3Q9BQP9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms