Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPIN3Q9BQK8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LPIN3Q9BQK8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms