Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms