Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPOCK3Q9BQ16 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms