Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP88Q99567 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP88Q99567 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms