Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP19Q99542 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms