Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NAP1L3Q99457 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms