Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALS2Q96Q42 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALS2Q96Q42 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms