Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC85AQ96PX6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC85AQ96PX6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms