Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS8

CLUHP3, Putative protein CLUHP3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUHP3Q96NS8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUHP3Q96NS8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLUHP3Q96NS8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms