Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LOXL4Q96JB6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXL4Q96JB6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms