Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITCHQ96J02 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITCHQ96J02 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITCHQ96J02 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITCHQ96J02 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITCHQ96J02 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITCHQ96J02 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITCHQ96J02 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITCHQ96J02 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITCHQ96J02 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITCHQ96J02 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITCHQ96J02 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms