Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM46AQ96IP4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM46AQ96IP4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM46AQ96IP4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM46AQ96IP4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM46AQ96IP4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM46AQ96IP4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM46AQ96IP4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM46AQ96IP4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM46AQ96IP4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM46AQ96IP4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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FAM46AQ96IP4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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FAM46AQ96IP4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM46AQ96IP4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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