Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC34Q96HJ3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms