Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BORCS6Q96GS4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BORCS6Q96GS4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BORCS6Q96GS4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms