Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23CQ96ET8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms