Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms