Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC8Q96B26 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms