Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX21Q969T3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms