Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR2Q969E8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TSR2Q969E8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSR2Q969E8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSR2Q969E8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSR2Q969E8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSR2Q969E8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TSR2Q969E8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TSR2Q969E8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TSR2Q969E8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TSR2Q969E8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TSR2Q969E8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TSR2Q969E8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSR2Q969E8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSR2Q969E8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TSR2Q969E8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
TSR2Q969E8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TSR2Q969E8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TSR2Q969E8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSR2Q969E8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TSR2Q969E8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSR2Q969E8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TSR2Q969E8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSR2Q969E8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TSR2Q969E8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSR2Q969E8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TSR2Q969E8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSR2Q969E8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TSR2Q969E8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TSR2Q969E8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TSR2Q969E8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TSR2Q969E8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TSR2Q969E8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TSR2Q969E8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSR2Q969E8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSR2Q969E8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSR2Q969E8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSR2Q969E8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSR2Q969E8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TSR2Q969E8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSR2Q969E8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSR2Q969E8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSR2Q969E8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSR2Q969E8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSR2Q969E8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TSR2Q969E8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSR2Q969E8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TSR2Q969E8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TSR2Q969E8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TSR2Q969E8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TSR2Q969E8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSR2Q969E8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSR2Q969E8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSR2Q969E8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TSR2Q969E8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSR2Q969E8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TSR2Q969E8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSR2Q969E8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TSR2Q969E8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSR2Q969E8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TSR2Q969E8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSR2Q969E8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSR2Q969E8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TSR2Q969E8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSR2Q969E8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TSR2Q969E8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TSR2Q969E8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TSR2Q969E8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms