Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT35Q92764 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms