Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSC1Q92574 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC1Q92574 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms