Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX92

NELFB, Negative elongation factor B, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFBQ8WX92 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NELFBQ8WX92 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NELFBQ8WX92 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NELFBQ8WX92 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NELFBQ8WX92 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NELFBQ8WX92 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms