Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms