Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD30

GPT2, Alanine aminotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPT2Q8TD30 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPT2Q8TD30 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPT2Q8TD30 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms