Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71BQ8TC56 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71BQ8TC56 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms