Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNDC9Q8TBE3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms