Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms