Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APPL2Q8NEU8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL2Q8NEU8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms