Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHDC9Q8NEP7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms