Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIML1Q8N9V2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIML1Q8N9V2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms