Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN12Q8IYM2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms