Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms