Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT28Q7Z3Y7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms