Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APTXQ7Z2E3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APTXQ7Z2E3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms