Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
STRCQ7RTU9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
STRCQ7RTU9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms