Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms