Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms