Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms