Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A47Q6Q0C1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms