Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
JMJD6Q6NYC1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
JMJD6Q6NYC1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms