Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms