Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SDE2Q6IQ49 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms