Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNS3Q68CZ2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNS3Q68CZ2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNS3Q68CZ2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNS3Q68CZ2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNS3Q68CZ2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNS3Q68CZ2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNS3Q68CZ2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNS3Q68CZ2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TNS3Q68CZ2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNS3Q68CZ2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNS3Q68CZ2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms