Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USPL1Q5W0Q7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms