Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms