Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF20Q5VTR2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF20Q5VTR2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms